Filtrace na principu uhlíkových filtrů z vody odstraní např. chlór, chlórové sloučeniny, pesticidy, organické nečistoty. U vícestupňových zařízení je uhlíkový filtr umístěn za filtrem na odstranění hmotných nečistot. UDF, CTO, GAC - nejpoužívanější typy uhlíkových filtrů.